La faune
La faune ressemble beaucoup à celle de la Chine et de la Corée, à cause des anciennes migrations qui ont eu lieu lorsque le Japon était encore rattaché au reste du continent asiatique. Cependant, certaines espèces du Japon sont uniques, comme la salamandre géante japonaise et le macaque japonais. Du nord au sud peuvent encore être aperçus quelques spécimens d'ours bruns, de phoques, de morses, de lions de mer, de belettes, d'hermines, de visons, d'aigles de mer, de guillemots, de cormorans huppés, de cygnes, de grues (tsuru), de canards sauvages, d'ours à collier de poils blancs, de cerfs, de sangliers, de loups, de renards, de fouines, de blaireaux (tanuki), de habu (grand serpent venimeux), de cigales (semi), de cancrelats (gokiburi), de hototogisu (sorte de rossignol), de zosterops, de colombes et de faucons. Si beaucoup de ces animaux sont en voie de disparition, en revanche un grand nombre d'oiseaux (geais) et de gibiers à plumes comme les faisans et les rapaces (aigles et faucons) sont encore communs. Voici trois exemples d'animaux que vous pourrez rencontrer.
Les cerfs de Nara. Ces cerfs Sika sont plus d'un millier et ils gambadent, sans hésitation, entre les visiteurs amusés et les étals des échoppes dans le grand parc de 500 hectares du Kasuga-taisha. Ils sont vraiment peu farouches. Il faut savoir que ces animaux sont considérés comme des messagers des dieux, on comprend alors mieux pourquoi ce sont les rois du parc. Vous pourrez aussi voir le cerf de Miyajima, plus petit que celui de Nara, lors d'une excursion sur l'île du même nom.
Les macaques du Japon. Ces singes, très répandus dans l'Archipel, sont également appelés « singes des neiges ». Grâce à leur épaisse fourrure, ils sont très résistants au froid et à la neige. Si vous décidez de vous rendre en hiver au parc aux singes de Jigokudani, dans la préfecture de Nagano, vous pourrez les contempler en train de se délecter d'un bain dans les sources d'eau chaude de la région.
Le crabe des neiges. Cette espèce de crabes vit dans les eaux froides de la mer du Japon. On les appelle ici les zuwaigani et les Japonais en raffolent l'hiver. Eh oui, ces crabes sont pêchés entre novembre et mars et leur prix peut vite grimper. Certains crabes ont même des appellations, ce qui peut aussi jouer sur leur cote de popularité auprès des fins gourmets.
La flore
La forêt occupe 68 % de l'archipel. On doit ce taux élevé au fait qu'elle couvre les montagnes et qu'elle fournit le matériau de base des constructions traditionnelles. On pourrait sommairement diviser le Japon en quatre zones botaniques. Il faut cependant garder à l'esprit que la multitude des microclimats et l'interpénétration des tendances entre les zones influencées par les vents venant de la mer du Japon et de celles soumises à l'influence du Pacifique sont à l'origine d'une grande diversité climatique et une grande variété florale.
Zone septentrionale aux influences arctiques. Cette zone couvre les espaces montagneux de l'île de Hokkaidō et le nord de Honshū. On y verra surtout des conifères comme les Todomatsu et les Shirabe, mais également des feuillus comme les Kamba et les Miyama-manakamado.
Zone septentrionale. Cette zone botanique couvre le nord de Honshū et le sud de Hokkaidō. On y rencontrera des arbres à feuilles caduques comme les bunas et, bien sûr, des conifères : le Hinoki et le Hiba, ainsi que les Sawakurumi et les Harunire.
Zone centrale. Cette zone s'étend sur la plus grande partie du Japon, car elle couvre le centre et le sud de Honshū, ainsi que l'île de Shikoku et le nord du Kyūshū. On y trouve de nombreuses variétés botaniques et des forêts tempérées aux arbres à feuilles persistantes (Shii, Sakaki, Tsubaki, Kashiwa), mais également différentes variétés de pins (Kuromatsu, Sugi, Hinoki, Kunugi et Konara).
Zone méridionale. C'est la zone qui couvre, grosso modo, le sud du Kyūshū et les îles Ryūkyū. Le climat oscille ici entre les influences chaudes et les zones tropicales. On y trouvera donc des arbres toujours verts, mais également des cocotiers, bananiers, camphriers, citronniers : Kusunoki et Tachibana.
D'une manière générale, la flore du Japon accueille les essences suivantes : pin, sapin, bambou, cryptomeria géant (sugi), gingko (arbre aux 40 écus), arbre à laque (urushi), camphrier (kusunoki), santal blanc, chêne dentelé, prunier (ume), daphné, cerisier (sakura), glycine, azalée, pivoine, iris, camélia, lotus, chrysanthème.
