Mammifères
Si les ongulés restent très nombreux avec une importante population de sangliers, de cerfs, de chevreuils et de mouflons, le plus emblématique des Pyrénées est sans conteste l'isard. Élégant et agile, il fait virevolter sa robe brune dans les prairies d'altitude et ses cornes fines, en forme de crochet, sont reconnaissables entre mille. Le bouquetin, bien que présent sur le territoire depuis la préhistoire, a trop longtemps été chassé comme trophée et bénéficie désormais d'un plan de réintroduction. Dans les hautes prairies, vous entendrez siffler à votre approche la marmotte ! Cachée dans un terrier sous les combes ou les rochers, elle affronte doucement les mois froids à l'instar de l'ours brun, roi de l'hibernation. Au total, 39 ursidés sont dans les Pyrénées, versants français et espagnol. L'hermine agite avec grâce sa belle fourrure qui blanchit en hiver. De la campagne aux sommets, sa curiosité légendaire court la lande avec une agilité d'exception. Depuis 2008, l'oreillard montagnard fait la fierté de la vallée d'Aure, où il a été recensé. Vous ne le trouverez que là-bas, c'est l'espèce la plus rare de la région. Il est aussi fragile que menacé. Le loup, le bouquetin et le lynx ont, eux, entièrement disparu des Hautes-Pyrénées.
Reptiles et amphibiens
Si un petit habitant ne manque pas dans le département, c'est bien le lézard et, sur les chemins de randonnée, ils seront nombreux à vous accompagner ! Certains sont même l'objet de toutes les attentions puisque des zones Natura 2000 assurent leur protection. On peut citer le bien nommé lézard montagnard des Pyrénées, dont la récente découverte étoffe l'espèce. La vipère aspic se délecte des sols rocailleux d'altitude. Facilement reconnaissable à sa petite tête triangulaire et au bout de son museau recourbé, elle nécessite une vraie prudence car elle est venimeuse et peut s'avérer mortelle. Dans ces zones humides, les salamandres et les tritons ont trouvé leur bonheur ainsi que les grenouilles (des Pyrénées !) et les crapauds parmi lesquels le rare crapaud accoucheur. Son habitat est exclusivement situé à plus de 2 500 m et il peut pourtant vivre plus de 30 ans. Sa survie est actuellement compromise, notamment à cause d'un champignon qui a décimé l'espèce.
Oiseaux
Ils fendent les cieux avec grâce. Les rapaces ont trouvé dans les Hautes-Pyrénées un habitat qu'ils semblent diriger en maîtres. Leur présence y est simplement exceptionnelle, vous trouverez de nombreuses buses et des faucons mais aussi de splendides aigles royaux comme le circaète Jean-le-Blanc qui vient en été se régaler des serpents. Dans les falaises, le vautour fauve veille et vous ne pourrez le confondre avec son vol plané lent très caractéristique. Il se plaît dans les estives et sa taille ferait presque concurrence aux 3 m d'envergure du « casseur d'os ». C'est sous ce nom qu'est appelé le pourtant très inoffensif gypaète barbu, un des plus emblématiques rapaces et un des plus rares. Espèce endémique, la perdrix des neiges ou le lagopède alpin l'est tout autant. Avec beaucoup de chance, vous pourrez observer le timide et discret Grand Tétras, communément appelé coq de bruyère, dont l'incroyable beauté du plumage est un enchantement.
Poissons
Ses 2 500 km de rivières drainent une riche population que les pêcheurs connaissent bien et la truite sauvage a trouvé son royaume dans les Hautes-Pyrénées. La plus rebelle mais aussi la plus appréciée reste la fameuse fario qui, depuis son introduction au Moyen Age, n'en finit pas de voir se multiplier ses adeptes. Vous pourrez l'admirer dans les eaux des 220 lacs de montagne où arc-en-ciel, ombles de fontaine, saumons et quelques plus rares ombles chevaliers, reconnaissables à leur couleur bleutée, ondulent à leurs côtés en toute quiétude. Les plans d'eau abritent poissons blancs, carpes et carnassiers.
Des espèces aquatiques
Le desman est un petit insectivore de 60 g, semi-aquatique et hyperactif, avec des pattes palmées et une curieuse trompe qui lui vaut le surnom de « rat-trompette ». Quasiment aveugle, ce minuscule emblème du département vit au bord des rivières. Plus facile à trouver, l'euprocte se reconnaît entre mille : il est le seul triton avec des ongles ! Sa peau grise a des pointes cornées. Il est un fabuleux héritage puisqu'il se trouvait déjà là à l'époque des dinosaures. Il affectionne les eaux claires et froides des lacs et torrents qui l'abritent. Deux espèces rares, à protéger et à approcher avec toute la délicatesse que leur fragilité mérite.
Arbres
Avec une végétation dite à étage, le territoire se change dès 900 m en véritable royaume montagnard empli de forêts. Hêtres, sapins, pins sylvestre s'y succèdent avant de laisser la place à l'étage subalpin parsemé de pins à crochets qui peuvent atteindre 500 ans, de rhododendron ferrugineux, dont les fleurs fuchsias et carmins sont un régal, de sorbiers des oiseleurs et de bouleaux. Cet enchantement verdoyant change à partir de 2 500 m où les saules nains résistent aux rudes conditions et au-delà, seuls les lichens affrontent le climat.
Fleurs et plantes rares
Avec 1 700 espèces dont 160 ne se trouvant que dans la chaîne des Pyrénées, le département affiche une flore exceptionnelle. A partir de mai, vous pourrez admirer cardamine à feuilles larges, valériane des Pyrénées, chardons à feuilles de carline, gispets ou grémils de Gaston. De 2 500 à 3 000 m, les fleurs prennent des couleurs vives comme le silène sans tige, le pavot parfumé ou la saxifrage d'Irat. Dans ce bouquet de délicatesse se distinguent le jaune éclatant des grappes du lys des Pyrénées dont la tige peut atteindre un mètre, l'iris bleu à la teinte foncée et vive ou encore la ramonde des Pyrénées qui s'agrippe sur les roches, sublime avec ses pétales mauves et son cœur orangé. Des espèces rares et uniquement locales.
Végétation sous-marine
Certaines fleurs du département ne peuvent que se développer en milieu aquatique, c'est le cas du saxifrage aux fleurs blanches qui parsème le long des ruisseaux. Parmi les espèces remarquables, la fragile et rare subulaire aquatique fait l'objet d'un plan de sauvetage local. Cette petite plante aux fleurs en forme de croix n'est présente que dans les Pyrénées et au seul point de la laquette inférieure d’Orédon dans la Réserve naturelle nationale du Néouvielle.
