Pendant l'Antiquité, le nom latin était Gaudiacus avant de devenir Johi ou Joy au cours du Moyen Age. On sait que Jouy-sur-Morin se situait sur la voie romaine reliant Paris à Reims, itinéraire dont subsiste le pont dit " des Romains ". Si d'autres découvertes montrent que le territoire de la commune était occupé à période gallo-romaine, son passé médiéval est mieux représenté avec l'église Saint-Pierre et Saint-Paul des XIIe-Xllle s. comprenant des fonts baptismaux Renaissance classés Monument historique. Jouy-sur-Morin réunit également un important patrimoine industriel avec d'anciennes usines, des vannages, des lavoirs, un pressoir et une gare.