Burnhaupt-le-Haut faisait partie de la seigneurie de Thann. Son histoire reste liée à celle de Burnhaupt-le-Bas, il semblerait, d'ailleurs qu'il n'existait qu'une seule église paroissiale pour les deux communes, et ce jusqu'au XVe siècle. Son annexe, le pont d'Aspach, joua un rôle assez important car il permettait de franchir la Doller. C'était un ancien péage, vraisemblablement créé par les comtes d'Eguisheim, d'où l'apparition du nom d'Exenbruck en 1945. Pendant la Première Guerre mondiale, village et annexe seront totalement détruits. Plus tard, les activités industrielles se concentreront au pont d'Aspach. Jusqu'au XVIIe siècle, Burnhaupt-le-Haut comptera plus d'habitants que Burnhaupt-le-Bas. La situation s'inversera par la suite.