Mentionné dès 1176 sous le nom de Mansus Houzen (groupe de maisons) dans un inventaire des biens de l'abbaye de Pairis, Houssen fut à l'origine un fief impérial du château de Pflixbourg. La commune revint ensuite aux seigneurs de Ribeaupierre jusqu'à la Révolution française. Par ailleurs, une sépulture de l'âge de bronze, des objets de l'époque romaine et un trésor de monnaies gauloises témoignent d'une occupation humaine des lieux bien plus ancienne. Construite à partir de 1862, l'église Saint-Maurice accueille régulièrement des concerts car elle dispose d'un bel orgue réalisé par Martin Rinckenbach et doté d'un buffet néo-roman de Théophile Klem.