Implanté sur un coteau en éperon, entre la rive gauche de l'Huisne et le tracé de la voie antique Le Mans/Chartres, le village de Villaines tire son nom du latin Villa, qui signifie vaste exploitation agricole, et de l'anthroponyme Gonais en référence au nom du possesseur de ce vaste domaine : Guillelmus Gonas. L'agglomération se développe à partir du Moyen Âge, à flanc de colline, autour de l'église mentionnée pour la première fois en 1257. Si elle est probablement d'origine romane, l'église Saint-Hilaire a été fortement remaniée aux XVIe et XIXe siècles. Commune rurale, Villaines-la-Gonais affiche une activité principalement agricole. L'exploitation des carrières calcaires et des meulières, qui anima un artisanat durant plusieurs siècles, est désormais oubliée. Au patrimoine local, outre l'église, on peut voir un lavoir et le château de Beauchamps (privé).