Haut lieu ecclésiastique poitevin, le nom de la commune viendrait de Melitius et acum (la ville de Melitios). La célèbre abbaye apparaît à maintes reprises dans l'histoire du Poitou. Le village celtique originel de l'île de Maillezais a disparu après les pillages normands. Le comte de Poitou, Guillaume Tête d'Etoupe, y établit une forteresse pour empêcher les Normands de remonter la Sèvre. C'est Emma, comtesse de Poitou, qui va construire l'abbaye, suite au miracle de Maillezais. Au XVIe siècle, Maillezais fut associée à La Rochelle. Aujourd'hui véritable capitale du marais, Maillezais voit son histoire confondue avec celle de son abbaye.